Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP1Q702N8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms