Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT9

DENND5B, DENN domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND5BQ6ZUT9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DENND5BQ6ZUT9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms