Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUT3

MFSD12, Major facilitator superfamily domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD12Q6NUT3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MFSD12Q6NUT3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms