Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms