Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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C9orf135Q5VTT2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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C9orf135Q5VTT2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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C9orf135Q5VTT2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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C9orf135Q5VTT2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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