Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FNDC7Q5VTL7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms