Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FRMPD1Q5SYB0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms