Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCID2Q5JVF3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms