Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms