Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf17Q53FE4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms