Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL40Q2TBA0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms