Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms