Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECM1Q16610 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms