Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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GABRA6Q16445 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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GABRA6Q16445 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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GABRA6Q16445 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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GABRA6Q16445 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
GABRA6Q16445 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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GABRA6Q16445 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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GABRA6Q16445 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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GABRA6Q16445 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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GABRA6Q16445 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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GABRA6Q16445 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABRA6Q16445 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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