Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SIX1Q15475 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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