Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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PUM3Q15397 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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PUM3Q15397 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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PUM3Q15397 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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PUM3Q15397 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PUM3Q15397 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
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