Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UBE3CQ15386 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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