Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms