Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAPTM4AQ15012 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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