Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMCO1Q147U7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
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