Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGB1Q14028 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNGB1Q14028 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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