Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP1A4Q13733 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP1A4Q13733 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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