Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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