Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms