Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCOF1Q13428 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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