Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms