Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFX1Q12986 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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