Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms