Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SREBF2Q12772 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SREBF2Q12772 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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