Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLFN5Q08AF3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms