Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD47Q08722 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD47Q08722 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD47Q08722 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD47Q08722 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD47Q08722 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD47Q08722 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD47Q08722 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms