Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LRP1Q07954 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms