Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TFF3Q07654 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TFF3Q07654 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TFF3Q07654 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TFF3Q07654 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TFF3Q07654 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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