Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms