Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ERCC6Q03468 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERCC6Q03468 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms