Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPCQ03188 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms