Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC079766.1-201ENST00000608774 427 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 C9orf135-201ENST00000377197 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AL121972.2-202ENST00000429386 586 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 TMX3-202ENST00000443099 913 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 RPL37A-205ENST00000446558 495 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC021546.1-201ENST00000518927 1031 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 KCNJ10-204ENST00000637644 1239 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 RNASEH2B-AS1-201ENST00000454605 1007 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SDHD-205ENST00000528048 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms