Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNFRSF17Q02223 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms