Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POU5F1Q01860 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms