Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MS4A2Q01362 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms