Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDK5Q00535 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms