Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms