Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3AP98173 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms