Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARF5P84085 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARF5P84085 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARF5P84085 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARF5P84085 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARF5P84085 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARF5P84085 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARF5P84085 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARF5P84085 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARF5P84085 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARF5P84085 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARF5P84085 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARF5P84085 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARF5P84085 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARF5P84085 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARF5P84085 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ARF5P84085 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARF5P84085 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARF5P84085 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARF5P84085 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARF5P84085 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARF5P84085 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARF5P84085 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARF5P84085 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF5P84085 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF5P84085 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF5P84085 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF5P84085 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF5P84085 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF5P84085 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF5P84085 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF5P84085 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF5P84085 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF5P84085 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF5P84085 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF5P84085 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF5P84085 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF5P84085 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF5P84085 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF5P84085 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF5P84085 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF5P84085 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF5P84085 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms