Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UFM1P61960 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UFM1P61960 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UFM1P61960 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms