Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBE2NP61088 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBE2NP61088 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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