Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MANFP55145 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MANFP55145 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MANFP55145 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms