Protein–RNA interactions for Protein: P52803

EFNA5, Ephrin-A5, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA5P52803 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EFNA5P52803 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA5P52803 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA5P52803 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA5P52803 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA5P52803 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA5P52803 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA5P52803 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA5P52803 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA5P52803 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA5P52803 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA5P52803 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA5P52803 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA5P52803 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA5P52803 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA5P52803 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA5P52803 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA5P52803 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA5P52803 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA5P52803 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA5P52803 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA5P52803 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA5P52803 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA5P52803 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EFNA5P52803 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms