Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR4P51679 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR4P51679 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR4P51679 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR4P51679 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR4P51679 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR4P51679 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR4P51679 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR4P51679 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR4P51679 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR4P51679 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR4P51679 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR4P51679 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR4P51679 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR4P51679 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR4P51679 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR4P51679 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR4P51679 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR4P51679 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR4P51679 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR4P51679 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCR4P51679 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCR4P51679 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCR4P51679 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms