Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DNA2P51530 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DNA2P51530 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DNA2P51530 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
DNA2P51530 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DNA2P51530 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNA2P51530 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNA2P51530 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNA2P51530 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNA2P51530 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNA2P51530 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNA2P51530 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNA2P51530 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms